Většina společností podala kontrolní hlášení za leden a únor 2016 včas. Některým ale zpočátku dělalo vyplnění problémy. Vyplynulo to z průzkumu společnosti Mazars, která jej provedla u měsíčních plátců DPH.
Podle průzkumu nebyla po podání kontrolního hlášení nutná následná komunikace s finančním úřadem u 92 % společností. Dalších 6 % obdrželo pětidenní výzvu od finančního úřadu, na základě které museli následně podat nové kontrolní hlášení. U necelých 2 % musely finanční úřady zahájit postup z odstranění pochybností. V rámci něj prověřovali například transakce, které nebyly dodavatelem ani odběratelem vykázány v kontrolních hlášeních stejným způsobem.