Za posledních 12 měsíců (do 30. dubna 2006) přepravila společnost poprvé ve své historii více než 2,1 miliónu cestujících, což představuje v porovnání se stejným obdobím končícím v dubnu 2005 nárůst o 72,5 %. Obsazenost letů se v daném období zvýšila o 3,9 procentního bodu na 77 %.
V měsíci dubnu se flotila letadel SkyEurope rozrostla o dva zcela nové stroje Boeing 737–700 nové generace, které byly ihned nasazeny do provozu na nové základně SkyEurope v Praze. Celkově tak společnost v létě 2006 provozuje flotilu 16 letadel Boeing 737.
Po zahájení provozu z nové pražské základny do původně sedmi destinací dne 10. dubna 2006 oznámila společnost o dva dny později otevření nových destinací z Prahy do Splitu a Dubrovníku. Od 3. června 2006 tak budou moci cestující z Prahy cestovat přímo do svých oblíbených chorvatských destinací.
